| 太魯閣國家公園山椒魚保育監測計畫 (112-113) | 動物 | 112-113 |
| 太魯閣國家公園淡水域魚蝦蟹類相調查及圖鑑編撰（112-113） | 動物 | 112-113 |
| 太魯閣國家公園野生動物資源保育及永續利用之整合系統模式建立 | 動物 | 112-113 |
| 大清水暨匯德廢棄礦區周邊山域野生哺乳動物種類與豐度監測計畫(111-112) | 動物 | 112 |
| 太魯閣國家公園臺灣獼猴族群分布與經營管理計畫(110-111年) | 動物 | 111 |
| 高山型國家公園山椒魚分布棲地、遺傳結構與生物學調查 | 動物 | 111 |
| 太魯閣國家公園中大型野生動物資源長期監測建構計畫(109-110) | 動物 | 110 |
| 全球氣候變遷鳥類遷徙路徑研究-太魯閣國家公園候鳥及留鳥(109-110) | 動物 | 110 |
| 太魯閣國家公園兩棲類之族群遺傳結構探討-以盤古蟾蜍為例(109-110) | 動物 | 110 |
| 太魯閣砂卡礑溪流生物監測系統建立與專書(108-109) | 動物 | 109 |
| 太魯閣國家公園山椒魚棲地調查與族群遺傳結構研究(107-108) | 動物 | 108 |
| 太魯閣國家公園鳥類遺傳多樣性研究(107-108) | 動物 | 108 |