太魯閣國家公園蘇花海岸地區，擁有極為特殊的地質景觀與生態系統。地質景觀的特殊處，在於其緊臨太帄洋的除峭山勢，而生態系統的特殊處，則在於因地形屏障而相對於全世界大多數海岸生態系統，較少遭受人為干擾。蘇花海岸生態系，因而提供了我們一個極佳的海岸生態系研究場域。本研究進行生態系環境因子，親緣地理學，以及焦點珍稀物種的初步探討，以期建立蘇花海岸的長期生態系研究。
蘇花海岸地區特殊的地形地貌不但是世界性的地質景觀，也是影響台灣生物多樣性與遺傳多樣性的重要地形阻隔。這個地形阻隔同時扮演著東西分化與南北分化的界限，無論從單純的物種組成，或藉由近年分子親緣地理學所得到的證據，均顯示這個地理屏障在生物地理學上佔有重要的地位。而在如此小的尺度之內發生如此劇烈的物種與遺傳差異，亦為世界所罕見。因此，本研究將跳脫傳統著眼於台灣全島尺度的生物地理或親緣地理學研究，而進一步針對蘇花海岸，尤其是清水斷崖與立霧溪這段劇烈的地形屏障進行小尺度的探討。
在焦點物種的保育與監測上，太魯閣國家公園稀有植物的種類雖冠於台灣其他國家公園，但稀有植物分佈及瀕危等級的資料尚未完備，遑論物種的族群數量估計、族群成長趨勢、風險評估、潛在分佈範圍的模擬等研究。因此，本研究擬建立蘇花海岸地區稀有植物的基本資料庫，包括物種名錄的建立，稀有及瀕危等級的評估，以及分佈範圍、類型、稀有尺度、瀕危物種的分佈模擬等具體目標。藉此，希望能提供國家公園在面對遊憩、狩獵或開發等壓力時，擬定經營管理策略的參考。